El nombre Staphylococcus deriva de la palabra griega staphulê, que significa racimo de uvas, disposición habitual en la que crecen las bacterias pertenecientes a este género. Estas agrupaciones en racimos irregulares se producen porque no hay una separación completa de las células hijas tras una división celular que sucede en múltiples planos.
Pertenecen a la familia Staphylococcaceae, recientemente aceptada (Schleifer & Bell 2010). Fueron reconocidos por Robert Koch en 1878 y cultivados por Pasteur en 1880. Muy extendidos en la naturaleza, los estafilococos se encuentran en piel, glándulas y membranas mucosas de animales homeotermos.
En humanos, las tres especies más importantes son Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis y Staphylococcus saprophyticus.
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